| MirGeneDB ID | Hmi-Mir-29-o4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-29 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Panther worm (Hofstenia miamia) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hmi-Mir-29-o5a Hmi-Mir-29-o5b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Gsp-Mir-29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | H. miamia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Hofstenia_miamia.HmiaM1.dna.nonchromosomal) |
SCFE01000363.1: 723590-723644 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGCACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGUGGAUAGUUUCUCUAUGAAGAAUAUUUGUCCGGUUUAACAGUGGUGCCUAUAUUUUGUGUAUAGCACCAUGUGAAACCGGUCUCCACCCCUUGGGUAAUCUCAACGUUAGGUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGUGGAUAGUUUCUCUAUG--| AAUAUUUGU A G C UUU AAG CCGGUUU ACA UGGUGC UAUA \ UUC GGCCAAA UGU ACCACG AUAU U AUGGAUUGCAACUCUAAUGGG^ CCCACCUCU G - - GUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hmi-Mir-29-o4_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCGGUUUAACAGUGGUGCCUAUA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Hmi-Mir-29-o4_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- UAGCACCAUGUGAAACCGGUCU -55
Get sequence
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