MirGeneDB ID | Hmi-Mir-12496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12496 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Panther worm (Hofstenia miamia) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Sro-Mir-12496-P1 Sro-Mir-12496-P2 Sro-Mir-12496-P3 Xbo-Mir-12496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Xenacoelomorpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Xenacoelomorpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Hofstenia_miamia.HmiaM1.dna.nonchromosomal) |
SCFE01000760.1: 17273-17323 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGUGCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCACUUAUAGUCUUAAAUUGGAAGCAAAAGCGUCAGUGGCACAUGCAUUAACUUAUGAGUUGUGCAUACGUUACUGACUCUCAAUCUAGAAGCCGCAGUGGAGGUACGUUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UCACUUAUAGUCUUAAA-----| AGCAAA C AC U U UUGGA AG GUCAGUGGC AUGCAU AACU A GAUCU UC CAGUCAUUG UACGUG UUGA U CUUGCAUGGAGGUGACGCCGAA^ AAC--- U CA - G . 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hmi-Mir-12496_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGUCAGUGGCACAUGCAUUAACU -23
Get sequence
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Mature sequence | Hmi-Mir-12496_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
29- UUGUGCAUACGUUACUGACUCU -51
Get sequence
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