MirGeneDB ID | Hme-Mir-2767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2767 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hme-mir-2767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Hmel_1) |
HE671115: 285746-285800 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGUAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAGAUAUUCGUUAAUUUUUAUUGUCGUUCAAAGUAAAUCUCGUGCGGCUUGUUUUUAUUCCAAGCUGUAAGAGAUUCACUUAGAUUGAUGAUAGAUAAUUCUGCAAACUACAAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GAAGAUAUUCGUUAAUU--| UG U A A G UUUU UUUAU UCG UC AAGU AAUCUC UGCGGCUUG \ AGAUA AGU AG UUCA UUAGAG AUGUCGAAC U AAACAUCAAACGUCUUAAU^ GU U A C A CUUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hme-Mir-2767_5p |
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mirBase accession | MIMAT0024957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAAGUAAAUCUCGUGCGGCUUG -22
Get sequence
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Star sequence | Hme-Mir-2767_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
33- AGCUGUAAGAGAUUCACUUAGA -55
Get sequence
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