| MirGeneDB ID | Gpa-Mir-927-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-927 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tsetse fly (Glossina pallidipes) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-927-P1 Aga-Mir-927-P1 Bge-Mir-927-P1 Dan-Mir-927-P1 Dlo-Mir-927-P1 Dme-Mir-927-P1 Dmo-Mir-927-P1 Dsi-Mir-927-P1 Dya-Mir-927-P1 Hme-Mir-927-P1 Tca-Mir-927-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GpalI1) |
Scaffold91: 322631-322691 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-927-P1-v1) |
Mir-927-P1-v2
Scaffold91: 322630-322692 [-]
Ensembl
Mir-927-P1-v1 Scaffold91: 322631-322691 [-] Ensembl |
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| Variant | Gpa-Mir-927-P1-v1 |
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| Seed | UUAGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUUUUUGACACUCGUGGACAUACUUUGAUUUAGAAUUCCUACGCUUUACCUUAUGAUCUGAAAUUGGCAAAGCGUUUGGAUUCUGAAACAAAUUGUCUCCUCUAAUUCAACGAUUGCACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUUUUUUUGACACUCGU--| C C A CU A UUAUGAU GGA AUA UUUG UUUAGAAUUC ACGCUUU CC \ CCU UGU AAAC AAGUCUUAGG UGCGAAA GG C CACGUUAGCAACUUAAUCU^ C U A UU C UUAAAGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Gpa-Mir-927-P1-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUAGAAUUCCUACGCUUUACC -22
Get sequence
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| Star sequence | Gpa-Mir-927-P1-v1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CAAAGCGUUUGGAUUCUGAAAC -61
Get sequence
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| Variant | Gpa-Mir-927-P1-v2 |
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| Seed | UUUAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUUUUUUGACACUCGUGGACAUACUUUGAUUUAGAAUUCCUACGCUUUACCUUAUGAUCUGAAAUUGGCAAAGCGUUUGGAUUCUGAAACAAAUUGUCUCCUCUAAUUCAACGAUUGCACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUUUUUUUUGACACUCGU--| C C A CU A UUAUGAU GGA AUA UUUG UUUAGAAUUC ACGCUUU CC \ CCU UGU AAAC AAGUCUUAGG UGCGAAA GG C ACACGUUAGCAACUUAAUCU^ C U A UU C UUAAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Gpa-Mir-927-P1-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUUAGAAUUCCUACGCUUUACC -23
Get sequence
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| Star sequence | Gpa-Mir-927-P1-v2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CAAAGCGUUUGGAUUCUGAAACA -63
Get sequence
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