| MirGeneDB ID | Esc-Mir-12499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12499 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Hawaiian bobtail squid (Euprymna scolopes) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Npo-Mir-12499 Obi-Mir-12499 Ovu-Mir-12499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Cephalopoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Cephalopoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (esc-GCA_024364805.1_ASM2436480v1) |
CM044518.1: 1547139-1547197 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACACCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUUGAAAGCCCACUCGCGGGAGUCGGCGAACACCCGAGUGAGCGGCUGAGGAUUACGAAAUAUGCCGAGCCCUUACGAGGGUGUUCGUUGACAUUCGUACUUCACAGGGAUAUAUGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUUUUGAAAGCCCACUC--| A GA C GA AUUACG GCGGG GUCGGCGAACACCC GUGAG GGCU GG \ UGCUU CAGUUGCUUGUGGG CAUUC CCGA CC A CGUAUAUAGGGACACUUCA^ A AG - G- GUAUAA 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Esc-Mir-12499_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACACCCGAGUGAGCGGCUGAGGA -24
Get sequence
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| Star sequence | Esc-Mir-12499_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCGAGCCCUUACGAGGGUGUUCG -59
Get sequence
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