MirGeneDB ID | Efe-Mir-2691-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2691 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Common brandling worm (Eisenia fetida) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Efe-Mir-2691-P2 Efe-Mir-2691-P3 Efe-Mir-2691-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cte-Mir-2691 Pdu-Mir-2691-P1 Snu-Mir-2691 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | E. fetida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Sipuncula + Pleistoannelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Efe_combined) |
Efet.01.521505: 1585-1650 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUUGCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUCUGUUAGUCGUCGCCAGGUGGAUUCAACCGGCGGUGACAUUGUGCAAAGCCUUGUACUCUUGAAAAGCAGGUUUUGCAAUGUUUCACGGUCGGUUGCGUUCGUCUCAUGUCAUCGGAGCCGAGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GUCUGUUAGUCGUCGCC--| GU U G C UG UUGUACUC AG GGAU CAACCGGC GUGA AU UGCAAAGCC U UC CUUG GUUGGCUG CACU UG ACGUUUUGG U GGAGCCGAGGCUACUGUAC^ UG C G U UA ACGAAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Efe-Mir-2691-P1_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGGCGGUGACAUUGUGCAAAGCC -23
Get sequence
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Mature sequence | Efe-Mir-2691-P1_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- UUUUGCAAUGUUUCACGGUCGGU -66
Get sequence
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