| MirGeneDB ID | Ebu-Mir-7-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAAGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Inshore hagfish (Eptatretus burgeri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ebu-Mir-7-P5 Ebu-Mir-7-P7 Ebu-Mir-7-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-7 Asu-Mir-7 Bfl-Mir-7 Bge-Mir-7 Bla-Mir-7 Cgi-Mir-7 Cin-Mir-7 Cte-Mir-7 Dan-Mir-7 Dma-Mir-7 Dme-Mir-7 Dmo-Mir-7 Dsi-Mir-7 Dya-Mir-7 Esc-Mir-7 Hme-Mir-7 Isc-Mir-7 Lan-Mir-7 Lgi-Mir-7 Lpo-Mir-7 Npo-Mir-7 Obi-Mir-7 Ovu-Mir-7 Pfl-Mir-7 Pmi-Mir-7 Sko-Mir-7 Spu-Mir-7 Tca-Mir-7 Xbo-Mir-7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | E. burgeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Eburgeri_3) |
FYBX02010298.1: 382509-382571 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGGCACGGUGAGCUGGGCAGGGGCCGUGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUACCACUUGCACAUGCACAACAAGUCACGGUCUGCCGCACGGAGCCGCCUCUCGUCUUCAUGAAGGGGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAGGCACGGUGAGCUG---| A GG A A U UUACCACU GGC GG CCGUGUGG AGACU GUGAUUU GUUGU \ CCG CC GGCACGCC UCUGG CACUGAA CAACA U GGGGGAAGUACUUCUGCUCU^ - GA G - - CGUACACG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ebu-Mir-7-P6_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUU -25
Get sequence
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| Star sequence | Ebu-Mir-7-P6_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- ACAACAAGUCACGGUCUGCCGCA -63
Get sequence
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