MirGeneDB ID | Dsi-Mir-982-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-982 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-982b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dsi-Mir-982-P1 Dsi-Mir-982-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dme-Mir-982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
X: 3953690-3953747 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-982-P2) |
Mir-982-P3
X: 3953288-3953349 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2582-P2 X: 3953548-3953605 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P2 X: 3953690-3953747 [-] UCSC Ensembl Mir-2582-P1 X: 3954183-3954240 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P1 X: 3954323-3954388 [-] UCSC Ensembl Mir-303 X: 3955015-3955071 [-] UCSC Ensembl Mir-983 X: 3957115-3957173 [-] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUACACG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAAGUUAAAAAACAAAAUCAUGCUAGAUCAAGAACAAAUAUCAUGUAAAUUGAUUUUUUAAAUCAACUACACGAUAUUCGUUCUUGAGCUUAAUGGUUCUAGAGCUGCAAGAAAAAUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGAAGUUAAAAAACAAA---| GCU A A A AA AUUUU AUCAU AG UCAAGAAC AAUAUC UGUA UUG \ UGGUA UC AGUUCUUG UUAUAG ACAU AAC U UAAAAAGAACGUCGAGAUCU^ AU- G C C C- UAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dsi-Mir-982-P2_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0037360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAGAACAAAUAUCAUGUAAAUUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dsi-Mir-982-P2_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0012514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- ACUACACGAUAUUCGUUCUUGA -58
Get sequence
|