| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-955 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-955 Dme-Mir-955 Dmo-Mir-955 Dya-Mir-955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3L: 3195958-3196020 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-955) |
Mir-282
3L: 3148587-3148651 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-955 3L: 3195958-3196020 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AUCGUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGAACUCUUUUUGGCCAGCUAAUCAACUCCAUCGUGCAGAGGUUUGAGUGUCCUGUGUUUUGCCUAAUCGCAUUCAAUUUCUGCACGGUAGAGAUGGUACGCUUAGAAACAACCUAAAGAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGAACUCUUUUUGGCC--| UA A C U CCUGUGUU AGC AUCA CUC AUCGUGCAGAGGUU GAGUGU U UCG UGGU GAG UGGCACGUCUUUAA CUUACG U AAAGAAAUCCAACAAAGAU^ CA A A - CUAAUCCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dsi-Mir-955_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0012447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAUCGUGCAGAGGUUUGAGUGUC -23
Get sequence
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| Star sequence | Dsi-Mir-955_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0012448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAUUCAAUUUCUGCACGGUAGA -63
Get sequence
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