| MirGeneDB ID | Dno-Mir-885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-885 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-885 Cfa-Mir-885 Cja-Mir-885 Eca-Mir-885 Hsa-Mir-885 Laf-Mir-885 Mml-Mir-885 Mmr-Mir-885 Ocu-Mir-885 Pab-Mir-885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH570235: 996212-996265 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCAUUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCCCAAGGCUGCCGCUCGGCCCACACUCUCUCCAUUACACUACCCUGCCUCUUCUCCACGAGAGGCAGCUGGGUGUAGCGGAUAGAGCACGGGUUCAAGUCCCAGCUCCACCGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCCCAAGGCUGCCGCUC--| ACA C A ACC UCU GGCCC CUCU UCC UUACACU CUGCCUCU C UUGGG GAGA AGG GAUGUGG GACGGAGA C CGCCACCUCGACCCUGAAC^ CAC U C GUC GCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-885_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCAUUACACUACCCUGCCUCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-885_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
32- AGGCAGCUGGGUGUAGCGGAUA -54
Get sequence
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