MirGeneDB ID | Dno-Mir-544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-544 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-544 Cfa-Mir-544-P1 Cfa-Mir-544-P2 Cja-Mir-544 Eca-Mir-544 Ete-Mir-544 Hsa-Mir-544 Laf-Mir-544 Mml-Mir-544 Mmr-Mir-544 Mmu-Mir-544 Ocu-Mir-544 Pab-Mir-544 Rno-Mir-544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH568269: 667114-667184 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUUGUUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAUUUUAUGUGUUCAAGAAUUAUUUGGGAAUCUUGUUAAAAUGCAGAUUCUGAUUCAGUAGGUUUGGGGCAGGGCCUGAGAUUCUGCAUUUUGAGCAAGCUUCUGGUGAUGCUGAUGCUGUUUCCAAGAGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GAUUUUAUGUGUUCAAGA---| UG U - U GAUUCAGUAGGUU AUUAUU GGAA CUUG UUAAAAUGCAGA UCU \ UAGUGG UCUU GAAC AGUUUUACGUCU AGA U CGAGAACCUUUGUCGUAGUCG^ -- C G U GUCCGGGACGGGG . 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dno-Mir-544_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCUUGUUAAAAUGCAGAUUCUGA -23
Get sequence
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Star sequence | Dno-Mir-544_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
50- AUUCUGCAUUUUGAGCAAGCU -71
Get sequence
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