MirGeneDB ID | Dno-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-326 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-326 Cfa-Mir-326 Cja-Mir-326 Cpo-Mir-326 Eca-Mir-326 Ete-Mir-326 Hsa-Mir-326 Laf-Mir-326 Mml-Mir-326 Mmr-Mir-326 Mmu-Mir-326 Ocu-Mir-326 Pab-Mir-326 Rno-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH565704: 173567-173626 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUCUGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUCCCGUGAGCCUCCCCUGUCUGCUGGGCUGGAGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCGGGUUGUGCUCGGAUCGCCUCUGGGCCCUUCCUCCAGCCCAGAGGCGGAUUCUCCACGAGGCUGAGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GUCCCGUGAGCCUCCCC---| G C UUGUGA GGUUGU UGUCU CUGGGCUGGAGG AGGGCCU AGGCG G GCGGA GACCCGACCUCC UCCCGGG UCCGC C GGAGUCGGAGCACCUCUUAG^ - U UC---- UAGGCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-326_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GGAGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCG -24
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-326_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047806 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG -60
Get sequence
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