| MirGeneDB ID | Dme-Mir-957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-957 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAAACCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-957 Dan-Mir-957 Dmo-Mir-957 Dsi-Mir-957 Dya-Mir-957-P1 Dya-Mir-957-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Diptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Diptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3L: 22518210-22518277 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUUAUAUCCGUAGUGUUGUCCACAAUAGACCUUAGUUUUCGACGUGUUUUGGUGUGCUGGGGAGUUCUAUUCCGAUUGAAACCGUCCAAAACUGAGGCCAACUGUGAGGCGCGAGCAUCUAUCCAAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUUAUAUCCGUAGUGUU- -| AUAGA C U UG GUGCUGGGGA GUC CACA CCUUAGUUUU GACG GUUU GU \ CGG GUGU GGAGUCAAAA CUGC CAAA UA G AAAACCUAUCUACGAGCG A^ CAACC C - GU GCCUUAUCUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-957_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUAGUUUUCGACGUGUUUUGGU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-957_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
46- UGAAACCGUCCAAAACUGAGGC -68
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005470 TargetScanFly: dme-miR-957 |
