| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-6012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-6012 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-6012-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bge-Mir-6012 Tca-Mir-6012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087234.1: 3682468-3682530 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-6012-v2) |
Mir-6012-v1
NC_087234.1: 3682468-3682530 [-]
Ensembl
Mir-6012-v2 NC_087234.1: 3682468-3682530 [-] Ensembl |
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| Variant | Dlo-Mir-6012-v2 |
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| Seed | UUCGGCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGGAUUGCGCUGUUGGGGCAGGGUUAACAGGCUGAUAUUGUCGGGCGGGGUGUGGAACACGAAAGUCAUUUCGGCGAUGAGAUCAGCCUGUCAAACCCGGCACCACUCCUGCCACAAGAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGAGGAUUGCGCUGUUGGG- A A-| A UG GG GG UGGAAC GC GGGUU ACAGGCUGAU U UCG CG GUG A CG CCCAA UGUCCGACUA A AGC GC UAC C AGAGAACACCGUCCUCACCA G AC^ G GU G- UU UGAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dlo-Mir-6012-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGCUGAUAUUGUCGGGCGGGGUG -24
Get sequence
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| Mature sequence | Dlo-Mir-6012-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UUUCGGCGAUGAGAUCAGCCUGU -63
Get sequence
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| Variant | Dlo-Mir-6012-v1 |
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| Seed | UCGGCGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGGAUUGCGCUGUUGGGGCAGGGUUAACAGGCUGAUAUUGUCGGGCGGGGUGUGGAACACGAAAGUCAUUUCGGCGAUGAGAUCAGCCUGUCAAACCCGGCACCACUCCUGCCACAAGAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGAGGAUUGCGCUGUUGGG- A A-| A UG GG GG GUGGAAC GC GGGUU ACAGGCUGAU U UCG CG GU A CG CCCAA UGUCCGACUA A AGC GC UA C AGAGAACACCGUCCUCACCA G AC^ G GU G- UU CUGAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dlo-Mir-6012-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGCUGAUAUUGUCGGGCGGGGU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dlo-Mir-6012-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UUCGGCGAUGAGAUCAGCCUGU -63
Get sequence
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