MirGeneDB ID | Tca-Mir-6012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-6012 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Red flour beetle (Tribolium castaneum) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | tca-mir-6012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bge-Mir-6012 Dlo-Mir-6012-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Tcas5.2) |
LG3: 7388637-7388698 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCGGCGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAGACAAUCUGGUGGUGUGCAGGGUGAACAGACUGAUCUUGUUUCUGCGGAAAUGUUAGUUACAGUCAUUUCGGCGAUGAGAUCAGCCUGUCGAACCCAGCUCGAGUUCGUUCAACACUUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AAAGACAAUCUGGUGGU- U A GA-| A UG UCU G AAUGUUAGU G GC GGGU ACAG CUGAUCU UU GC GA \ C CG CCCA UGUC GACUAGA AG CG CU U UUUCACAACUUGCUUGAG U A AGC^ C GU --- G UUACUGACA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Tca-Mir-6012_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0023565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGACUGAUCUUGUUUCUGCGGA -22
Get sequence
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Mature sequence | Tca-Mir-6012_3p |
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mirBase accession | MIMAT0023566 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UUCGGCGAUGAGAUCAGCCUGU -62
Get sequence
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