MirGeneDB ID | Dlo-Mir-2765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-2765 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2765 Aga-Mir-2765 Bge-Mir-2765 Hme-Mir-2765 Tca-Mir-2765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087229.1: 563619-563676 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGUAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGUUAAUUAUCCUUAGAGUGCAUUAAGACUUGGUAACUCCACCACCGUUGGCGUAUAAUUGAUAGUCAAUGGGGUACGAGUUUCCGUUUUUCAGUGCUGAUGAGACAACGGUGAUUAAGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AGUUAAUUAUCCUUAGAGU-- A CU U C-| A GUAUA GCAUU AGA UGG AACUC ACC CCGUUGGC A CGUGA UUU GCC UUGAG UGG GGUAACUG U AAUUAGUGGCAACAGAGUAGU C UU U CA^ - AUAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dlo-Mir-2765_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGUAACUCCACCACCGUUGGC -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dlo-Mir-2765_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CAAUGGGGUACGAGUUUCCGUU -58
Get sequence
|