MirGeneDB ID | Aae-Mir-2765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2765 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-2765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-2765 Bge-Mir-2765 Dlo-Mir-2765 Hme-Mir-2765 Tca-Mir-2765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.1: 5248310-5248367 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGUAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUAAGCUGGACAAAAACGUUUCCGGAGCCUGGUAACUCCACCACCGUUGGCGAUAUUUGACAGCCAAUGGGAGCUGGAGUUCCCGCGUGCCGAACGUUCAUUCAUCAAUGCAGUGAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUUAAGCUGGACAAAAA----| UC A C U CCA- GAUAU CGUU CGG GC UGG AACUCCA CCGUUGGC \ GCAA GCC UG GCC UUGAGGU GGUAACCG U AAGUGACGUAACUACUUACUU^ -- G C C CGAG ACAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aae-Mir-2765_5p |
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mirBase accession | MIMAT0014285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGUAACUCCACCACCGUUGGC -22
Get sequence
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Star sequence | Aae-Mir-2765_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CAAUGGGAGCUGGAGUUCCCGCG -58
Get sequence
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