MirGeneDB ID | Aga-Mir-2765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2765 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2765 Bge-Mir-2765 Dlo-Mir-2765 Hme-Mir-2765 Tca-Mir-2765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064601.1: 35939460-35939517 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGUAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUGCUCACUAGUGACACGUUUCCGGAGCCUGGUAACUCCACCACCGUUGGCGAGAUUCGACUGCCAAUGGGAGCUGGAGUUUCCGCGUGCCGAACGUUAAUGCGUCGAGAUGGAACCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 ACUGCUCACUAGUGACA----| UC A C U CCA- GAGAU CGUU CGG GC UGG AACUCCA CCGUUGGC \ GCAA GCC UG GCC UUGAGGU GGUAACCG U CCAAGGUAGAGCUGCGUAAUU^ -- G C U CGAG UCAGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aga-Mir-2765_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGUAACUCCACCACCGUUGGC -22
Get sequence
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Star sequence | Aga-Mir-2765_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CAAUGGGAGCUGGAGUUUCCGCG -58
Get sequence
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