| MirGeneDB ID | Cte-Mir-184-P17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-184 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGACGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Polychaete worm (Capitella teleta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cte-mir-184b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cte-Mir-184-P16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-184 Aca-Mir-184 Ami-Mir-184 Asu-Mir-184 Bfl-Mir-184 Bge-Mir-184 Bla-Mir-184 Bpl-Mir-184 Bta-Mir-184 Cfa-Mir-184 Cin-Mir-184 Cli-Mir-184 Cmi-Mir-184 Cpi-Mir-184 Cpo-Mir-184 Dan-Mir-184 Dma-Mir-184 Dme-Mir-184 Dmo-Mir-184 Dno-Mir-184 Dpu-Mir-184 Dsi-Mir-184 Dya-Mir-184 Esc-Mir-184 Ete-Mir-184 Gga-Mir-184 Gja-Mir-184 Hme-Mir-184 Hsa-Mir-184 Isc-Mir-184 Lan-Mir-184 Lch-Mir-184 Loc-Mir-184 Mdo-Mir-184 Mml-Mir-184 Mmu-Mir-184 Npo-Mir-184 Oan-Mir-184 Ocu-Mir-184 Pbv-Mir-184 Pfl-Mir-184 Pma-Mir-184 Pmi-Mir-184 Rno-Mir-184 Sha-Mir-184 Sko-Mir-184 Spt-Mir-184 Spu-Mir-184 Sto-Mir-184 Tca-Mir-184 Tgu-Mir-184 Xtr-Mir-184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. teleta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Capitella_teleta_v1.0) |
CAPTEscaffold_291: 120376-120436 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-184-P17) |
Mir-184-P16
CAPTEscaffold_291: 120205-120266 [+]
Ensembl
Mir-184-P17 CAPTEscaffold_291: 120376-120436 [+] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUAUGAAGUGCGUUAUGAUACAUCACGUUCCCUUGUCACUUGUUCGUCCUGUUGGCUGCGUUUUCUCACUGGACGGAGAACUGAUAGGGCCCUGUGUGGAUCACGUGACGACCUCUCUUUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUAUGAAGUGCGUUAUGAUA---| U UUC C G U UGGCUGC CA CACG CCUUGUCA UU UUCGUCC GU \ GU GUGU GGGAUAGU AA AGGCAGG CA G UUUUCUCUCCAGCAGUGCACUAG^ - CCC C G U CUCUUUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cte-Mir-184-P17_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUUGUCACUUGUUCGUCCUGU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cte-Mir-184-P17_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UGGACGGAGAACUGAUAGGGCC -61
Get sequence
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