MirGeneDB ID | Csc-Mir-3931-P8a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3931 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Arizona bark scorpion (Centruroides sculpturatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Csc-Mir-3931-P8b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Isc-Mir-3931 Tur-Mir-3931 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. sculpturatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Chelicerata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000671375.1_CSC) |
NW_019384305.1: 1207374-1207432 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-3931-P8a) |
Mir-3931-P8b
NW_019384305.1: 1189312-1189370 [-]
Ensembl
Mir-3931-P8a NW_019384305.1: 1207374-1207432 [-] Ensembl |
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Seed | ACUUUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUCAAAGGAGGAGGAACGUGAAAGAGGUGAUUUGUACCGAAUCAUAGAUAGGUUAUGGUUGUACACUACUUUGAGUCGGUACAAAUCAUUUCCAUCACGUCUAACAUCUGGUUCAUUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UAUCAAAGGAGGAGGAA--| AA A U A GUUAUG CGUGA GAGGUGAUUUGUACCGA UCA AG UAG G GCACU CUUUACUAAACAUGGCU AGU UC AUC U CUUACUUGGUCUACAAUCU^ AC G U - ACAUGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Csc-Mir-3931-P8a_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUUUGUACCGAAUCAUAGAUAGGU -24
Get sequence
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Mature sequence | Csc-Mir-3931-P8a_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UACUUUGAGUCGGUACAAAUCA -59
Get sequence
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