| MirGeneDB ID | Cja-Mir-1307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1307 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1307 Cfa-Mir-1307 Dno-Mir-1307 Eca-Mir-1307 Hsa-Mir-1307 Laf-Mir-1307-v1 Mml-Mir-1307 Mmr-Mir-1307-v1 Ocu-Mir-1307 Pab-Mir-1307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021926.1: 93039966-93040027 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCGGCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGCUGAGUCACUGUCACUGCCUACCAAUCUCGACCGGACCUCGACCGGCUCGUCUCUGUUGCCAAUCGACUCGGCGUGGCGUCGGUCGUGGUAGAUAGGCGGUCAUGCAUACGAAUUUUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAGCUGAGUCACUGUCA-- CCA U A-| U A GC UCUCUG CUGCCUA AUC CGACCGG CC CG CCG UCG U GGCGGAU UGG GCUGGCU GG GC GGC AGC U ACUUUUAAGCAUACGUACU AGA U GC^ U - UC UAACCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cja-Mir-1307_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGACCGGACCUCGACCGGCUCG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Cja-Mir-1307_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- ACUCGGCGUGGCGUCGGUCGUGG -62
Get sequence
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