| MirGeneDB ID | Cbr-Mir-7595-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7595 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis briggsae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cbr-mir-7595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cbr-Mir-7595-P2a Cbr-Mir-7595-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. briggsae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. briggsae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (CB4) |
I: 14505055-14505117 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7595-P1) |
Mir-7595-P2a
I: 14504081-14504142 [-]
Ensembl
Novel-1 I: 14504857-14504917 [-] Ensembl Mir-7595-P1 I: 14505055-14505117 [-] Ensembl Novel-2 I: 14505335-14505393 [-] Ensembl |
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| Seed | ACCCGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUUUAUGUCGCAUCCCUAAACGGCAUGGUACCCGUUAACUCGAAGAAAGUGUUAAGCAUCAUCUUUCACACUUUCUCGGUUGACGGGUACCGGGCCCAAGUAUGGCUUUAUGGGUCCUCUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUUUUUAUGUCGCAUCCCUAAAC--| A U A UAAGCAU GGC UGGUACCCGUUAAC CGA GAAAGUGU \ CCG GCCAUGGGCAGUUG GCU CUUUCACA C AUCUCCUGGGUAUUUCGGUAUGAAC^ G - - CUUUCUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cbr-Mir-7595-P1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0029602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACCCGUUAACUCGAAGAAAGUGU -24
Get sequence
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| Star sequence | Cbr-Mir-7595-P1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- ACUUUCUCGGUUGACGGGUACC -63
Get sequence
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