| MirGeneDB ID | Cbr-Mir-7591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7591 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis briggsae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cbr-mir-7591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. briggsae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. briggsae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (CB4) |
IV: 15802497-15802558 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7591-v1) |
Novel-6-P2
IV: 15799529-15799590 [-]
Ensembl
Novel-6-P1 IV: 15800970-15801031 [-] Ensembl Mir-7591-v1 IV: 15802497-15802558 [+] Ensembl Mir-7591-v2 IV: 15802497-15802558 [+] Ensembl |
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| Variant | Cbr-Mir-7591-v1 |
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| Seed | AUCGGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGUAAUCCCCCCCCCCCCCCCAUGGGGACAAGAGAUUCCUGAGACCUGAUUCUAGAAGCUUCCCCUAGAAUCGGUAUCCGGACCCUCUGGUCCCCUGGAAAAAGGGGCGGAGCCUAUUUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAGUAAUCCCCCCCCCCCCC---| U A AU U G U AGAAGC CCA GGGGAC AGAG UCC GA ACC GAUUCU \ GGU CCCCUG UCUC AGG CU UGG CUAAGA U UCUUUAUCCGAGGCGGGGAAAAA^ - G CC C A - UCCCCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cbr-Mir-7591-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGAGAUUCCUGAGACCUGAUUCU -24
Get sequence
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| Mature sequence | Cbr-Mir-7591-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0029597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAUCGGUAUCCGGACCCUCUGGU -62
Get sequence
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| Variant | Cbr-Mir-7591-v2 |
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| Seed | UCGGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGUAAUCCCCCCCCCCCCCCCAUGGGGACAAGAGAUUCCUGAGACCUGAUUCUAGAAGCUUCCCCUAGAAUCGGUAUCCGGACCCUCUGGUCCCCUGGAAAAAGGGGCGGAGCCUAUUUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAGUAAUCCCCCCCCCCCCC---| U A AU U G U UAGAAGC CCA GGGGAC AGAG UCC GA ACC GAUUC \ GGU CCCCUG UCUC AGG CU UGG CUAAG U UCUUUAUCCGAGGCGGGGAAAAA^ - G CC C A - AUCCCCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cbr-Mir-7591-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGAGAUUCCUGAGACCUGAUUC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Cbr-Mir-7591-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0029597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- AUCGGUAUCCGGACCCUCUGGU -62
Get sequence
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