MirGeneDB ID | Aga-Mir-2796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2796 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aga-mir-2796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2796 Bge-Mir-2796 Dlo-Mir-2796 Hme-Mir-2796 Tca-Mir-2796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064601.1: 22148090-22148149 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAGGCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUACGGACCAAGCGGGCGGUUCCGGGGGCAGGGGUUUCUUUCGGCCUCCAGCAGCAUUUGACCGUUGUAGGCCGGCGGAAACUACUUGCUUCCGUCGUUCCCGUUCUACAAGGAAAGGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGUACGGACCAAGCGGGC UUC-- -| U C AGCAU GG CGGGGGCAGG GGUUUCU UCGGCCU CAGC \ CC GCCUUCGUUC UCAAAGG GGCCGGA GUUG U AGGAAAGGAACAUCUUGC UUGCU A^ C U CCAGU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aga-Mir-2796_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0041533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGGUUUCUUUCGGCCUCCAGCAG -25
Get sequence
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Mature sequence | Aga-Mir-2796_3p |
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mirBase accession | MIMAT0041534 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- GUAGGCCGGCGGAAACUACUUGC -60
Get sequence
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