MirGeneDB ID | Aae-Mir-2796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2796 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-2796 Bge-Mir-2796 Dlo-Mir-2796 Hme-Mir-2796 Tca-Mir-2796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.309: 120075-120135 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAGGCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUCGUUACAUAUGAGAAAAUCGAAGGAAGAAGGGGUUUCUUUCGGCCUCCAGCGGCAUUAGAAAGUUGUAGGCCGGCGGAAACUACUUGCUUCCGUCGUUUAAAAACAUCUGAUUAAUAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 ACUCGUUACAUAUGAGA--| U A - GG U C CGGCAU AAA CGA GGAAG AAG GUUUCU UCGGCCU CAG \ UUU GCU CCUUC UUC CAAAGG GGCCGGA GUU U AAUAAUUAGUCUACAAAAA^ - G G AU C U GAAAGA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aae-Mir-2796_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAGGGGUUUCUUUCGGCCUCCAG -23
Get sequence
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Mature sequence | Aae-Mir-2796_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- GUAGGCCGGCGGAAACUACUUGC -61
Get sequence
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