Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | Br | Em | Em | He | Ve | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-27-P2 | xtr-mir-27b | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0003571 | chr1 | 123463716 | 123463778 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-27-P3 | xtr-mir-27a | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0003570 | chr3 | 129999287 | 129999348 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-27-P4 | xtr-mir-27c-1 | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0003675 | chr4 | 73605412 | 73605473 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all