Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | Br | Em | Em | He | Ve | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-1-P1 | xtr-mir-1a-1 | MIR-1 | GGAAUGU | None | MIMAT0003551 | chr6 | 93553291 | 93553351 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-1-P2 | xtr-mir-206 | MIR-1 | GGAAUGU | None | MIMAT0003623 | chrUn_NW_016683369v1 | 1079510 | 1079569 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-1-P3 | xtr-mir-1a-2 | MIR-1 | GGAAUGU | None | MIMAT0003551 | chrUn_NW_016683679v1 | 104671 | 104732 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-1-P4 | xtr-mir-1b | MIR-1 | GGAAUGU | None | MIMAT0003648 | chr2 | 56468864 | 56468924 | - | Gnathostomata | Bilateria | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all