Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | Br | Em | Em | He | Ve | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-133-P4 V | xtr-mir-133d | MIR-133 | UUGGUCC | None | MIMAT0003596 | chr2 | 56468434 | 56468492 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | Yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-133-P3 V | xtr-mir-133c | MIR-133 | UUGGUCC | None | MIMAT0003595 | chrUn_NW_016683679v1 | 81400 | 81459 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | Yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-133-P2 V | xtr-mir-133b | MIR-133 | UUGGUCC | None | MIMAT0003597 | chrUn_NW_016683369v1 | 1078326 | 1078384 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xtr-Mir-133-P1 V | xtr-mir-133a | MIR-133 | UUGGUCC | None | MIMAT0003708 | chr6 | 93550870 | 93550929 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all