| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P1b3 V | xla-mir-10b | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0046424 | MIMAT0046425 | NC_030740.1 | 67996928 | 67996989 | - | X. laevis | Eumetazoa | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P1b4 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NC_030741.1 | 62207498 | 62207557 | - | X. laevis | Eumetazoa | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P1c3 V | xla-mir-10a | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0046422 | MIMAT0046423 | NC_030740.1 | 3499572 | 3499633 | - | X. laevis | Eumetazoa | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P1c4 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NC_030741.1 | 3133739 | 3133800 | - | X. laevis | Eumetazoa | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P1d3 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NC_030726.1 | 148240763 | 148240821 | - | X. laevis | Eumetazoa | 2 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P1d4 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NC_030727.1 | 128693658 | 128693716 | - | X. laevis | Eumetazoa | 2 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
