| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-199-P1c V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | NC_030730.1 | 98473473 | 98473533 | + | X. laevis | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-199-P1d V | xla-mir-199 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0046510 | MIMAT0046511 | NC_030731.1 | 80439840 | 80439900 | + | X. laevis | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-199-P3a | None | MIR-199 | CCAGUGU | None | None | NC_030728.1 | 132099453 | 132099513 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-199-P3b | None | MIR-199 | CCAGUGU | None | None | NW_016694811.1 | 452651 | 452711 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
