Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-24-P3d | None | MIR-24 | GGCUCAG | None | None | NW_016694811.1 | 2508830 | 2508890 | + | X. laevis | Vertebrata | Yes | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-24-P3c | xla-mir-24b-1 | MIR-24 | GGCUCAG | None | MIMAT0011146 | NC_030728.1 | 133946953 | 133947013 | + | X. laevis | Vertebrata | Yes | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-24-P2d | xla-mir-24a-1 | MIR-24 | GGCUCAG | MIMAT0046550 | MIMAT0046551 | NC_030725.1 | 110864858 | 110864916 | + | X. laevis | Vertebrata | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-24-P2c | xla-mir-24a-2 | MIR-24 | GGCUCAG | MIMAT0046550 | MIMAT0046551 | NC_030724.1 | 133829567 | 133829625 | + | X. laevis | Vertebrata | Yes |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all