| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Em | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-124-P3d V | xla-mir-124-2 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0046428 | MIMAT0046429 | NC_030741.1 | 15894757 | 15894816 | + | X. laevis | Bilateria | 2 | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-124-P3c V | None | MIR-124 | AAGGCAC | None | None | NC_030740.1 | 17160989 | 17161048 | + | X. laevis | Bilateria | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-124-P2d V | xla-mir-124-1 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0046430 | MIMAT0046429 | NC_030733.1 | 131342483 | 131342543 | + | X. laevis | Bilateria | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-124-P2c V | None | MIR-124 | AAGGCAC | None | None | NC_030732.1 | 152280148 | 152280208 | + | X. laevis | Bilateria | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-124-P1d V | None | MIR-124 | AAGGCAC | None | None | NC_030735.1 | 95146970 | 95147028 | + | X. laevis | Bilateria | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-124-P1c V | None | MIR-124 | AAGGCAC | None | None | NC_030734.1 | 119078106 | 119078164 | + | X. laevis | Bilateria | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
