Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-26-P1c | None | MIR-26 | UCAAGUA | None | None | NC_030734.1 | 8319770 | 8319830 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-26-P1d | None | MIR-26 | UCAAGUA | None | None | NC_030735.1 | 6761303 | 6761363 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-26-P2e | xla-mir-26-2 | MIR-26 | UCAAGUA | MIMAT0046555 | MIMAT0046557 | NC_030740.1 | 52888537 | 52888597 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-26-P2f | None | MIR-26 | UCAAGUA | None | None | NC_030741.1 | 48190685 | 48190745 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-26-P4a | xla-mir-26-1 | MIR-26 | UCAAGUA | MIMAT0046555 | MIMAT0046556 | NC_030726.1 | 143656238 | 143656298 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-26-P4b | None | MIR-26 | UCAAGUA | None | None | NC_030727.1 | 124697493 | 124697553 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all