Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-128-P1a | None | MIR-128 | CACAGUG | None | None | NC_030734.1 | 64275444 | 64275501 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-128-P1b | None | MIR-128 | CACAGUG | None | None | NC_030735.1 | 55536815 | 55536872 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-128-P2c | xla-mir-128-1 | MIR-128 | CACAGUG | MIMAT0046440 | MIMAT0046439 | NC_030740.1 | 51150867 | 51150923 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-128-P2d | xla-mir-128-2 | MIR-128 | CACAGUG | MIMAT0046438 | MIMAT0046439 | NC_030741.1 | 46578438 | 46578494 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all