| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-551-P1a | None | MIR-551 | CGACCCA | None | None | NC_030736.1 | 95971706 | 95971763 | + | X. laevis | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-551-P1b | None | MIR-551 | CGACCCA | None | None | NC_030737.1 | 70129845 | 70129902 | + | X. laevis | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-551-P2a | None | MIR-551 | CGACCCA | None | None | NC_030732.1 | 109161745 | 109161805 | - | X. laevis | Vertebrata | Yes | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-551-P2b | None | MIR-551 | CGACCCA | None | None | NC_030733.1 | 93299008 | 93299068 | - | X. laevis | Vertebrata | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
