| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-33-P1c | None | MIR-33 | UGCAUUG | None | None | NC_030740.1 | 111938572 | 111938631 | - | X. laevis | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-33-P1d | xla-mir-33a | MIR-33 | UGCAUUG | MIMAT0046580 | MIMAT0046581 | NC_030741.1 | 99915860 | 99915919 | - | X. laevis | Bilateria | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-33-P3a | xla-mir-33b | MIR-33 | UGCAUUG | MIMAT0046582 | MIMAT0046583 | NC_030730.1 | 112596721 | 112596781 | + | X. laevis | Bilateria | Yes | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-33-P3b | None | MIR-33 | UGCAUUG | None | None | NC_030731.1 | 94508913 | 94508973 | - | X. laevis | Bilateria | Yes | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
