Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Sp | Sp | Sp | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tni-Mir-27-P1 | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | 15_random | 3094204 | 3094266 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tni-Mir-27-P2b | tni-mir-27b | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0002952 | 12 | 8516519 | 8516581 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tni-Mir-27-P3 | tni-mir-27c | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0003078 | 3 | 8970188 | 8970245 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tni-Mir-27-P4a | tni-mir-27e | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0003068 | 1 | 16059190 | 16059253 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tni-Mir-27-P4b | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | 15_random | 2810064 | 2810128 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all