Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Fe | Fe | Fe | Fe | Ma | Ma | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-34-P1 | tgu-mir-34a | MIR-34 | GGCAGUG | MIMAT0014598 | None | 21 | 696980 | 697045 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-34-P2a | tgu-mir-34c-1 | MIR-34 | GGCAGUG | MIMAT0016928 | MIMAT0027033 | 24 | 5982700 | 5982758 | + | Vertebrata | Bilateria | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-34-P2b | None | MIR-34 | GGCAGUG | None | None | 24 | 5983297 | 5983351 | + | Vertebrata | Bilateria | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-34-P3a | None | MIR-34 | GGCAGUG | None | None | Z | 55413848 | 55413910 | - | Gnathostomata | Bilateria | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-34-P3c | None | MIR-34 | GGCAGUG | None | None | Z | 55412726 | 55412782 | - | Gnathostomata | Bilateria | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-34-P3d | None | MIR-34 | GGCAGUG | None | None | Z | 55411777 | 55411835 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all