| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Fe | Fe | Fe | Fe | Ma | Ma | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tgu-Mir-338-P1 | tgu-mir-338 | MIR-338 | CCAGCAU | MIMAT0017389 | MIMAT0014542 | 14 | 1435957 | 1436016 | + | Vertebrata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tgu-Mir-338-P2 | None | MIR-338 | ACAAUAU | None | None | 18 | 1498115 | 1498175 | + | Vertebrata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tgu-Mir-338-P2-as | None | MIR-338 | CAGCACC | None | None | 18 | 1498111 | 1498175 | - | Amniota | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
