Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ad | Ea | Em | Em | Em | Em | Em | Fe | Fe | Fe | Fe | Oo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-11624-P1a | tca-mir-11624a-1 | MIR-11624 | GAUAUGC | MIMAT0045523 | MIMAT0045524 | LG5 | 505653 | 505713 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-11624-P1b | tca-mir-11624a-2 | MIR-11624 | GAUAUGC | MIMAT0045523 | MIMAT0045524 | LG5 | 48829 | 48889 | - | T. castaneum | T. castaneum | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-11624-P2 | tca-mir-11624a-3 | MIR-11624 | GAUAUGC | MIMAT0045523 | MIMAT0045525 | LG5 | 505254 | 505313 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-11624-P4 | tca-mir-11624c | MIR-11624 | GAUAUGC | MIMAT0045544 | MIMAT0045545 | LG6 | 9853278 | 9853338 | + | T. castaneum | T. castaneum | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all