| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ad | Ea | Em | Em | Em | Em | Em | Fe | Fe | Fe | Fe | Oo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tca-Mir-11619-P1 | tca-mir-11619a-1 | MIR-11619 | GAAGAGU | MIMAT0045515 | MIMAT0045558 | KQ972170 | 7940 | 7998 | - | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tca-Mir-11619-P2 | tca-mir-11619a-2 | MIR-11619 | GAAGAGU | MIMAT0045515 | MIMAT0045558 | KQ972170 | 29392 | 29450 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tca-Mir-11619-P3 | tca-mir-11619a-3 | MIR-11619 | GAAGCGU | MIMAT0045515 | MIMAT0045516 | LG2 | 374318 | 374376 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tca-Mir-11619-P4 | tca-mir-11619e | MIR-11619 | UGAGGAG | MIMAT0045499 | MIMAT0045500 | LG2 | 1144051 | 1144110 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tca-Mir-11619-P5 | tca-mir-11619f | MIR-11619 | GAGAGUU | MIMAT0045508 | MIMAT0045509 | LG2 | 1139937 | 1139997 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
