Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ag | Ag | Di | Gf | Ne | Ph | Se | Se | Se | Se | Se | Se | Se | Se | Se | Se | Se | Wh | Wh | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sme-Mir-190-P19 | sme-mir-756 | MIR-190 | GAUAUGU | MIMAT0004023 | MIMAT0012127 | NNSW01000125_dd_Smes_g4_125 | 1007325 | 1007389 | + | S. mediterranea | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sme-Mir-190-P20 | sme-mir-190a | MIR-190 | GAUAUGU | MIMAT0004001 | MIMAT0004002 | NNSW01000018_dd_Smes_g4_18 | 365786 | 365839 | + | S. mediterranea | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sme-Mir-190-P21 | sme-mir-190b | MIR-190 | GAUAUGU | MIMAT0004003 | MIMAT0004004 | NNSW01000083_dd_Smes_g4_83 | 666744 | 666807 | - | S. mediterranea | Bilateria | No | 1 | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all