Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bo | Br | He | Ki | Li | Ly | Pa | Sk | Sp | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-8-P1a | sha-mir-200b | MIR-8 | AAUACUG | None | MIMAT0022804 | GL849763.1 | 160136 | 160195 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-8-P1b | sha-mir-200c | MIR-8 | AAUACUG | None | MIMAT0022825 | GL861612.1 | 2158081 | 2158143 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-8-P2a | sha-mir-200a | MIR-8 | AACACUG | None | MIMAT0022805 | GL849763.1 | 162456 | 162515 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-8-P2b | sha-mir-141 | MIR-8 | AACACUG | None | MIMAT0022826 | GL861612.1 | 2158494 | 2158558 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-8-P3a | None | MIR-8 | AAUACUG | None | None | GL849763.1 | 166823 | 166881 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all