Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-208-P3b | None | MIR-208 | UGCUCCU | None | None | NC_046093.1 | 2192594 | 2192652 | + | P. marinus | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-208-P3a3 V | pma-mir-208 | MIR-208 | UAAGACG | MIMAT0019520 | MIMAT0019521 | NC_046131.1 | 4412220 | 4412281 | + | P. marinus | Vertebrata | 2 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-208-P3a2 V | pma-mir-208 | MIR-208 | UAAGACG | MIMAT0019520 | MIMAT0019521 | NC_046131.1 | 4412220 | 4412281 | + | P. marinus | Vertebrata | 2 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-208-P3a1 V | pma-mir-208 | MIR-208 | UAAGACG | MIMAT0019520 | MIMAT0019521 | NC_046131.1 | 4412220 | 4412281 | + | P. marinus | Vertebrata | 2 | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all