Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-17-P1g | pma-mir-17a | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0019383 | MIMAT0019384 | NC_046115.1 | 748761 | 748823 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-17-P3g | pma-mir-17b | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0019385 | None | NC_046115.1 | 749682 | 749742 | + | P. marinus | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-17-P3h V | pma-mir-17c | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0019386 | None | NC_046132.1 | 1979765 | 1979827 | + | P. marinus | Vertebrata | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-17-P4g | pma-mir-20a | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0019395 | MIMAT0019396 | NC_046115.1 | 751997 | 752055 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-17-P4h | pma-mir-20b | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0019397 | None | NC_046132.1 | 1982814 | 1982876 | + | P. marinus | Vertebrata | Unknown | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all