Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | 24 | 24 | 24 | 24 | 24 | 36 | 36 | 36 | 36 | 36 | 48 | 48 | 48 | 48 | 48 | 6d | 6d | 6d | 6d | 72 | 72 | 72 | 72 | 72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-242-P4a | None | MIR-242 | UGCGUAG | None | None | JAPTHN010000007.1 | 29826411 | 29826473 | + | P. dumerilii | Nephrozoa | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-242-P4b | None | MIR-242 | UGCGUAG | None | None | JAPTHN010000007.1 | 29826777 | 29826839 | + | P. dumerilii | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-242-P4c | None | MIR-242 | UGCGUAG | None | None | JAPTHN010000007.1 | 29827092 | 29827154 | + | P. dumerilii | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-242-P4d | None | MIR-242 | UGCGUAG | None | None | JAPTHN010000007.1 | 29836784 | 29836846 | + | P. dumerilii | Nephrozoa | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all