Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | 24 | 24 | 24 | 24 | 24 | 36 | 36 | 36 | 36 | 36 | 48 | 48 | 48 | 48 | 48 | 6d | 6d | 6d | 6d | 72 | 72 | 72 | 72 | 72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-279-o47 | None | MIR-279 | UGACUGU | None | None | JAPTHN010000003.1 | 90160575 | 90160628 | - | P. dumerilii | Protostomia | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-279-o46 | None | MIR-279 | GACUAGA | None | None | JAPTHN010000003.1 | 17716402 | 17716456 | + | P. dumerilii | Protostomia | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-279-o45 | None | MIR-279 | GACUAGA | None | None | JAPTHN010000009.1 | 2657711 | 2657763 | - | P. dumerilii | Protostomia | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-279-o44 | None | MIR-279 | GACUAGA | None | None | JAPTHN010000001.1 | 184772430 | 184772489 | - | P. dumerilii | Protostomia | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all