Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | He | Ki | Te | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ocu-Mir-1-P1 | ocu-mir-1-2 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0048091 | MIMAT0048092 | chr9 | 63183544 | 63183604 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ocu-Mir-1-P2 | ocu-mir-206 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0048327 | MIMAT0048328 | chr12 | 41638561 | 41638620 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ocu-Mir-1-P3 | None | MIR-1 | GGAAUGU | None | None | 1985387934 | 431 | 491 | + | Gnathostomata | Bilateria | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all