Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Ce | He | Ki | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Oan-Mir-17-P1a | oan-mir-17 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0007278 | MIMAT0007279 | NC_041737.1 | 22690068 | 22690128 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Oan-Mir-17-P1c | oan-mir-106 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0006849 | MIMAT0006850 | NC_041733.1 | 24650384 | 24650441 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Oan-Mir-17-P4a7 | oan-mir-20a-2 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0007145 | MIMAT0009169 | NC_041737.1 | 22689543 | 22689601 | - | O. anatinus | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Oan-Mir-17-P4a8 | oan-mir-20a-1 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0007145 | MIMAT0007146 | NC_041737.1 | 29148077 | 29148135 | - | O. anatinus | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Oan-Mir-17-P4c | oan-mir-20b | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0006853 | MIMAT0006854 | NC_041733.1 | 24650009 | 24650072 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all