Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Fe | Fe | In | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-199-P1a V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | KV884749.1 | 84487 | 84547 | - | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-199-P1b-as | None | MIR-199 | AACCAAU | None | None | KV884892.1 | 231065 | 231129 | - | M. albus | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-199-P1b V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | KV884892.1 | 231069 | 231129 | + | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-199-P2a V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | KV884737.1 | 2027135 | 2027195 | + | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-199-P3 V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | KV884793.1 | 1445883 | 1445943 | - | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all